Les Clans sont des groupes mutants, englobant plusieurs personnes ayant les même convictions. Il y a un chef pour chaque clan.
Il y a actuellement 3 clans:
- les X-mens (les bons)
- la Confrérie (les mauvais)
- Résurrection (les indépendants)
Vous pouvez choisir d'entrer dans l'un de ces clans soit au cours du jeu, soit dès le début en l'indiquant dans votre présentation.
Il est aussi possible de créer un Clan. Pour ça, voir le sujet correspondant^^.